大約幾百個核苷酸對長，是一個調(diào)節(jié)序列，通常位于啟動子和陽性調(diào)節(jié)元件(增強子)或陰性調(diào)節(jié)元件(異染色質(zhì))之間。玻璃絕緣子本身對基因表達既沒有正面作用，也沒有反面作用，但它的作用是阻止其他調(diào)控元件激活或失活基因。

高壓絕緣子的作用是有方向性的，這是在果蠅實驗中發(fā)現(xiàn)的。當轉(zhuǎn)座子gypsy插入果蠅黃色基因座Y時，某些組織中的Y基因會失活，但某些組織中的Y基因仍有活性。原因是轉(zhuǎn)座子吉普賽的一端有一個絕緣體序列。當gypsy插入/基因座的不同位置時，對基因活性產(chǎn)生不同的影響。這是因為Y基因的活性受四種增強子的調(diào)節(jié)。當絕緣體剛好插入啟動子的上游時，它阻斷了翅葉和體表皮組織中基因的激活(來自上游增強子)，但不阻斷剛毛和遠側(cè)爪組織中Y基因的表達(來自下游增強子)。

因為一些增強子位于啟動子的上游，一些位于啟動子的下游，所以絕緣子的作用不依賴于絕緣子和啟動子之間的相對位置。因此，絕緣子效應(yīng)的方向性的原因還沒有真正闡明。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有兩個位點影響絕緣子在反式激活中的功能?；騍2J(Hw)編碼的核蛋白識別絕緣體，絕緣子只有與其結(jié)合后才有絕緣功能。基因突變時，絕緣子雖然插入了Y位點，但失去了絕緣功能，Y在所有組織中都有表達。另一個位點是適度的。該基因突變后，其作用正好與Su(Hw)相反，即這些突變都增強了絕緣效果，使絕緣子的絕緣效果不再具有方向性和擴大性，即增強劑對上下游側(cè)的作用被阻斷。一種解釋是Su(Hw)與絕緣體的DNA結(jié)合，使絕緣子具有絕緣作用。mod(mdg4)和Su(Hw)的組合使絕緣子失去絕緣效果；突變mod(mdg4)無法與Su(Hw)組合，所以絕緣體增強了絕緣功能。

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